在知网本科指导下进行论文查重后的修改方向有多方面。首先，可以从文献综述入手，对查重结果中重复的部分进行深入分析和修改。其次，检查论文格式是否符合要求，包括参考文献格式、页眉页脚等。此外，还可以对论文内容进行逻辑性和连贯性的检查，确保论文表达清晰、条理清晰。最后，注意语言表达是否准确、规范，避免出现歧义或语法错误。

另外，在知网本科指导下进行论文查重后的修改方向还可以包括对数据和实验结果的再次核对和修正，确保数据的准确性和可靠性。同时，补充和完善论文中的不足之处，增加必要的论证和分析，使论文更加完整和具有说服力。此外，还可以邀请导师或专业人士进行审阅和建议，及时调整论文内容，提升论文质量和学术水平。